男鹿水族館内有400種、超過一萬隻的海洋生物，館内設有多個展區，包括男鹿之海大水槽、日本之海水魚CORNER、秋田之河川CORNER、珊瑚CORNER、亞馬遜CORNER等。除了這些外，當然少不了最吸睛的企鵝和海豹吧！館内亦設有觸摸池，讓參觀者用手觸摸在海岸棲息的海洋生物，透過觸摸瞭解海洋生物更多~